Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC048679D3YXE9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms