Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptprz1B9EKR1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms