Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cttnbp2B9EJA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cttnbp2B9EJA2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms