Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf11cB4XVP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf11cB4XVP9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms