Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm6133B2RY53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms