Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pnldc1B2RXZ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pnldc1B2RXZ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms