Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-bh2B2RVB7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms