Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrn3B2RS91 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rrn3B2RS91 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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