Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf3B2RQG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf3B2RQG2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms