Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf25B1AWN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfrsf25B1AWN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms