Protein–RNA interactions for Protein: B1AVM1

Gm12887, Predicted gene 12887, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12887B1AVM1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm12887B1AVM1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12887B1AVM1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms