Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930435E12RikA6X8Z9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms