Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prss40A6H6T1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss40A6H6T1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms