Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll13A4Q9F6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll13A4Q9F6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll13A4Q9F6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms