Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp8b5A3FIN4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms