Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2al1jA2BFR3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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