Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc183A2AJB1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc183A2AJB1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms