Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms