Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms