Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C87977A2A958 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms