Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm2A2A7B5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prdm2A2A7B5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prdm2A2A7B5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms