Protein–RNA interactions for Protein: A0N8R1

Trav12-1, T cell receptor alpha variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-1A0N8R1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav12-1A0N8R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-1A0N8R1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms