Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trav12-2A0N8N6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trav12-2A0N8N6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trav12-2A0N8N6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trav12-2A0N8N6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trav12-2A0N8N6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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