Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A286YDU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A286YDU1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms