Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms