Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv13-2A0A140T8N6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trbv13-2A0A140T8N6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trbv13-2A0A140T8N6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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