Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0U1RNP2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms