Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms