Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrpl40Q9Z2Q5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms