Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChrdQ9Z0E2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChrdQ9Z0E2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChrdQ9Z0E2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChrdQ9Z0E2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChrdQ9Z0E2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChrdQ9Z0E2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChrdQ9Z0E2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChrdQ9Z0E2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChrdQ9Z0E2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChrdQ9Z0E2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChrdQ9Z0E2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChrdQ9Z0E2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChrdQ9Z0E2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms