Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stub1Q9WUD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stub1Q9WUD1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stub1Q9WUD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stub1Q9WUD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stub1Q9WUD1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stub1Q9WUD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stub1Q9WUD1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stub1Q9WUD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stub1Q9WUD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stub1Q9WUD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stub1Q9WUD1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stub1Q9WUD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms