Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma1Q9R1P4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma1Q9R1P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma1Q9R1P4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psma1Q9R1P4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psma1Q9R1P4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psma1Q9R1P4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms