Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Dpf1Q9QX66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Dpf1Q9QX66 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Dpf1Q9QX66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Dpf1Q9QX66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Dpf1Q9QX66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Dpf1Q9QX66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Dpf1Q9QX66 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32,07■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Dpf1Q9QX66 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Dpf1Q9QX66 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Dpf1Q9QX66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Dpf1Q9QX66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31,81■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Dpf1Q9QX66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Dpf1Q9QX66 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Dpf1Q9QX66 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Dpf1Q9QX66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Dpf1Q9QX66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Dpf1Q9QX66 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Dpf1Q9QX66 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,6 ms