Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmx1aQ9JKU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lmx1aQ9JKU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmx1aQ9JKU8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmx1aQ9JKU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmx1aQ9JKU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmx1aQ9JKU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmx1aQ9JKU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmx1aQ9JKU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmx1aQ9JKU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmx1aQ9JKU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmx1aQ9JKU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmx1aQ9JKU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmx1aQ9JKU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmx1aQ9JKU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmx1aQ9JKU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms