Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrirQ9D735 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrirQ9D735 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrirQ9D735 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrirQ9D735 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrirQ9D735 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrirQ9D735 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrirQ9D735 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrirQ9D735 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrirQ9D735 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrirQ9D735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TrirQ9D735 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrirQ9D735 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrirQ9D735 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrirQ9D735 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms