Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc94Q9D6J3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc94Q9D6J3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc94Q9D6J3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc94Q9D6J3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc94Q9D6J3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc94Q9D6J3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc94Q9D6J3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc94Q9D6J3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc94Q9D6J3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc94Q9D6J3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc94Q9D6J3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc94Q9D6J3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc94Q9D6J3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc94Q9D6J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms