Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam90a1bQ9D4F3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam90a1bQ9D4F3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam90a1bQ9D4F3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms