Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmntd1Q9D4C1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmntd1Q9D4C1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmntd1Q9D4C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmntd1Q9D4C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmntd1Q9D4C1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmntd1Q9D4C1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd1Q9D4C1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd1Q9D4C1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmntd1Q9D4C1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms