Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Mis12Q9CY25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mis12Q9CY25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mis12Q9CY25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mis12Q9CY25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mis12Q9CY25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mis12Q9CY25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mis12Q9CY25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mis12Q9CY25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms