Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930524J08RikQ9CUJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930524J08RikQ9CUJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930524J08RikQ9CUJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930524J08RikQ9CUJ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms