Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspo2Q9CRZ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspo2Q9CRZ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspo2Q9CRZ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspo2Q9CRZ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspo2Q9CRZ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspo2Q9CRZ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspo2Q9CRZ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspo2Q9CRZ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms