Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rassf1Q99MK9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rassf1Q99MK9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rassf1Q99MK9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf1Q99MK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rassf1Q99MK9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rassf1Q99MK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rassf1Q99MK9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf1Q99MK9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms