Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lactb2Q99KR3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lactb2Q99KR3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lactb2Q99KR3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lactb2Q99KR3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lactb2Q99KR3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lactb2Q99KR3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lactb2Q99KR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lactb2Q99KR3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lactb2Q99KR3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lactb2Q99KR3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lactb2Q99KR3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lactb2Q99KR3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lactb2Q99KR3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms