Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg5Q99J83 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg5Q99J83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Atg5Q99J83 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg5Q99J83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg5Q99J83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg5Q99J83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atg5Q99J83 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg5Q99J83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg5Q99J83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg5Q99J83 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms