Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zkscan3Q91VW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zkscan3Q91VW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zkscan3Q91VW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan3Q91VW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan3Q91VW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan3Q91VW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan3Q91VW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan3Q91VW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan3Q91VW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan3Q91VW9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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