Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms