Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam20bQ8VCS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20bQ8VCS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20bQ8VCS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20bQ8VCS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam20bQ8VCS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam20bQ8VCS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam20bQ8VCS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam20bQ8VCS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam20bQ8VCS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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