Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm8Q8R4D5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm8Q8R4D5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpm8Q8R4D5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpm8Q8R4D5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpm8Q8R4D5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm8Q8R4D5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm8Q8R4D5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm8Q8R4D5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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