Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Abca5Q8K448 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Abca5Q8K448 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Abca5Q8K448 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,89■■■■■ 4,14
Abca5Q8K448 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,87■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,86■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Abca5Q8K448 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Abca5Q8K448 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Abca5Q8K448 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Abca5Q8K448 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Abca5Q8K448 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Abca5Q8K448 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,72■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Abca5Q8K448 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Abca5Q8K448 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,57■■■■■ 4,09
Abca5Q8K448 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Abca5Q8K448 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Abca5Q8K448 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Abca5Q8K448 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Abca5Q8K448 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Abca5Q8K448 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Abca5Q8K448 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Abca5Q8K448 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Abca5Q8K448 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Abca5Q8K448 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Abca5Q8K448 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,38■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,36■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Abca5Q8K448 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Abca5Q8K448 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Abca5Q8K448 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Abca5Q8K448 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40,21■■■■■ 4,03
Abca5Q8K448 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Abca5Q8K448 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Abca5Q8K448 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Abca5Q8K448 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Abca5Q8K448 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Abca5Q8K448 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Abca5Q8K448 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Abca5Q8K448 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,02■■■■■ 4
Abca5Q8K448 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Abca5Q8K448 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40■■■■□ 3,99
Abca5Q8K448 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,97■■■■□ 3,99
Abca5Q8K448 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39,96■■■■□ 3,99
Abca5Q8K448 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Abca5Q8K448 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Abca5Q8K448 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39,92■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Abca5Q8K448 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms