Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CIL4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CIL4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CIL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8CIL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8CIL4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8CIL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8CIL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CIL4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q8CIL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8CIL4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8CIL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8CIL4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CIL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q8CIL4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8CIL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8CIL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms