Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9030612E09RikQ8CE20 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
9030612E09RikQ8CE20 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
9030612E09RikQ8CE20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
9030612E09RikQ8CE20 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
9030612E09RikQ8CE20 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
9030612E09RikQ8CE20 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
9030612E09RikQ8CE20 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
9030612E09RikQ8CE20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
9030612E09RikQ8CE20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
9030612E09RikQ8CE20 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms